> Можно было подождать и не делать upstart совсем, не тратить на него свои ресурсы.

Когда делали upstart systemd еще на горизонте и небыло. Тут вопрос к RedHat.
> Простота unix какраз и позволила её так распростратиться. Вообще, мне кажется, чем проще - тем лучше.

Не совсем так, unix распространился потому что первый вышел в тираж. Но на эту тему можно долго дискутировать. Да чем проще тем лучше, но иногда очень простые решения не подходят.
> Насколько я понимаю, LSB требует от дистрибутива поддержки определенных возможностей. То, что дистрибутив поддерживает deb-пакеты, не закрывает ему путь к LSB. Дистрибутив просто должен поддерживать ещё и rpm. А alien позволяет какраз установить rpm-пакет в Debian-based систему. Причём с точки зрения пользователя именно установить rpm, а не сконвертить руками в deb и потом уже поставить deb. Разве я не прав?

Вы правы но не все пакеты будут работать корректно, да и не задача пользователя устанавливать пакеты, а администратора. К тому же мы знаем что поддержка будет сложнее, а поддержка съедает львиную долю времени системного администратора.