URL: https://www.opennet.ru/cgi-bin/openforum/vsluhboard.cgi
Форум: vsluhforumID3
Нить номер: 107461
[ Назад ]

Исходное сообщение
"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"

Отправлено opennews , 07-Апр-16 09:07 
Доступен (http://ugene.net/ru/news.html#060416) выпуск UGENE 1.22.0 (http://ugene.net/ru/), пакета для работы молекулярного биолога, предоставляющий  инструменты для множественного выравнивания нуклеотидных и аминокислотных последовательностей,  филогенетического анализа, редактирования и аннотирования нуклеотидных и белковых последовательностей,  поддержания биоинформационной базы данных, визуализации,  поиска геномных вариаций, работы с хроматограммами и многого другого (http://ugene.net/ru/key_features.html). Исходные тексты UGENE распространяются (http://ugene.unipro.ru/ru/download.html) под лицензией GPLv2, сборки доступны для Windows, Mac OS, Linux.


В новой версии представлены расширенные средства редактирования аннотаций в редакторе последовательностей. Упрощена конфигурация отображения рамок считывания. В интерфейсе ПЦР (https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9F%D0%... добавлена поддержка расширенного алфавита для праймеров. В NGS добавлена поддержка экcпорта участка сборки в форматы BAM, SAM и UGENE.

<center><a href="http://ugene.net/wp-content/themes/Ugene/gallery/images/3dst... src="https://www.opennet.ru/opennews/pics_base/0_1456299583.png&q... style="border-style: solid; border-color: #e9ead6; border-width: 15px;max-width:100%;" title="" border="0"></a></center>


URL: http://ugene.net/ru/news.html#060416
Новость: http://www.opennet.ru/opennews/art.shtml?num=44190


Содержание

Сообщения в этом обсуждении
"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено IMHO , 07-Апр-16 09:07 
а ГМО не поддерживает ?

"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено A.Stahl , 07-Апр-16 09:08 
Дай догадаюсь. Ты -- оранжевый апельсин?

"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено невидимка , 07-Апр-16 10:12 
Синий апельсин, а не оранжевый!

"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено shur , 07-Апр-16 10:35 
Да к тому же и заводной

"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено A.Stahl , 07-Апр-16 09:08 
>GPLv2

Пора обновлять. Сомневаюсь, что существуют принципиальные нюансы, диктующие вторую версию.


"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено Аноним , 07-Апр-16 12:16 
Тролите?
Linus Torvalds says GPL v3 violates everything that GPLv2 stood for

"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено A.Stahl , 07-Апр-16 13:01 
Столлман думает иначе. Если среди Д.Вейдера и Чёрного плаща или человека-паука и мишки Гамми ещё хрен знает кто круче, то между Столлманом и Торвальдсом круче, безусловно, Столлман.

"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено Аноним , 07-Апр-16 13:26 
В чём круче-то? Еmacs vs kernel?
*пошел за попкорном

"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено ананим.orig , 07-Апр-16 13:48 
Хороший вброс. Продолжим — гнушным гцц можно откомпилировать и ядро, и емакс, а ядром нет.

Зыж
В вопросах лицензионной политики. Не стройте из себя идиота.
Или сразу пишите, что это тролячий вброс, тогда ждем модератора с веником.
Ззыж
Линус просто банально физически не может перелицензироваться.
Вернее может, но это настолько трудозатратно, что не покрывает разнцу между в2 и в3.
А так то конечно в3 лучше. Тем более что юридически можно использовать в2+.


"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено _ , 07-Апр-16 16:53 
> Хороший вброс.

Уровень - Детсад :-\
> Продолжим — гнушным гцц можно откомпилировать и ядро, и емакс, а ядром нет.

А ещё ядро [почти] можно скомпилить ICC, LLVM и может чем то ещё, мне не надо я не узнавал...
... и Ёмакс тоже :)

Впрочем настоящие пацаны тупо используют линейку, а не всё вот это ...


"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено Какаянахренразница , 08-Апр-16 10:34 
> А ещё ядро [почти] можно скомпилить ICC, LLVM и может чем то
> ещё, мне не надо я не узнавал...
> ... и Ёмакс тоже :)

Без "почти". Интеловский компилятор точно умеет компилировать свежие версии ядра.



"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено Аноним , 07-Апр-16 16:56 
>Продолжим — гнушным гцц можно откомпилировать и ядро, и емакс, а ядром нет.

Нельзя ничего откомпилировать gcc в линуксе без ядра.
Но можно во фрях. Ок, Столлман круче.

>В вопросах лицензионной политики. Не стройте из себя идиота.

Если под "лицензионной политикой" Вы разумеете написание и публикование лицензий, тогда да, вопросов нет. Но, как бы, есть свобода использования множества лицензий, из которых можно выбрать. О чем и говорит Линус в видосе выше.

>Ззыж

Видос на youtube.


"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено Какаянахренразница , 08-Апр-16 10:27 
>>Продолжим — гнушным гцц можно откомпилировать и ядро, и емакс, а ядром нет.
> Нельзя ничего откомпилировать gcc в линуксе без ядра.
> Но можно во фрях. Ок, Столлман круче.

Не круче. Ядро тоже можно компилировать не-гнутым компилятором.



"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено Какаянахренразница , 08-Апр-16 10:26 
> Хороший вброс. Продолжим — гнушным гцц можно откомпилировать и ядро, и емакс,
> а ядром нет.

Мотив этой песни нам знаком.

Без ядра гнушным гцц нельзя будет компилировать, и в емаксе нельзя будет ... э ... емаксить. Скажете, что можно на другом ядре, да? Уж не на Хурде ли?


"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено Аноним , 07-Апр-16 15:12 
> В чём круче-то? Еmacs vs kernel?
> *пошел за попкорном

*заталкивая седую бороду за баян*
Линукс, как бы, просто ядро!
А в емаксе разве что текстового редактора для полного счастья не хватает, а так и шел есть и пакетный менеджер и игрушки и ФМ и браузер с почтовиком …



"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено Аноним , 07-Апр-16 17:20 
вы хотели написать текстового процессора?

"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.22.0"
Отправлено Какаянахренразница , 08-Апр-16 10:29 
> А в емаксе разве что текстового редактора для полного счастья не хватает

Какой правильный холивар, однако.